Fecha de creación
25 de agosto de 1887.
Historia de Fundación
Originalmente fue bautizada por Colón como isla de los Pinos en 1502. En el informe de 1582 aparece como pueblo de indios de Trujillo encomendados a la corona española con cuarenta tributarios. En el anuario de Vallejo de 1889 ya figura como municipio, categoría que se le dio el 25 de agosto de 1887.
Significado de su nombre
Guanaja es el nombre autóctono, sin embargo Cristóbal Colón la llamó Islas de los Pinos por la abundancia de este árbol en la zona.